Minden gyomorvizsgálatot éhgyomri állapotban célszerű elvégezni.

A gyomor vizsgálataiban radiológiai módszerek (gyomorröntgen, passzázs vizsgálat, ultrahangvizsgálat, komputertomográfia, mágneses rezonancia vizsgálat), száloptikás vizsgálatok (endoszkópia, endoszkópos ultrahang), funkcionális vizsgálatok (izotópos motilitási vizsgálat, többcsatornás impedancia vizsgálatok) egyaránt szerephez jutnak. Szövettani vizsgálathoz szükséges mintavétel csakis endoszkópos vizsgálat során lehetséges.

A radiológiai vizsgálatok során kontrasztanyagot kell lenyelni, amely láthatóvá teszi a gyomor mozgását, illetve a nyálkahártya bizonyos eltéréseit.

A funkcionális vizsgálatok egy részénél szintén le kell nyelni vékony eszközöket, amelyeken keresztül ellenállást lehet mérni. Az izotópos vizsgálatok izotóppal jelzett próbaételek vagy anyagok lenyelését követően speciális izotóp kamera alatti képalkotást igényelnek: fájdalmatlan, de hosszabb időt igénylő vizsgálatok.